16S+ITS測(cè)序的原理和用途
更新時(shí)間：2021-09-01 點(diǎn)擊次數(shù)：3851
16S+ITS測(cè)序是對(duì)特定長(zhǎng)度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進(jìn)行測(cè)序，目前主要是應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)特定環(huán)境中特定遺傳物質(zhì)進(jìn)行測(cè)序。大多數(shù)天然微生物都不能通過(guò)傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法進(jìn)行分離和克隆，這對(duì)于天然微生物定性和定量，探索微生物多樣性是嚴(yán)重的挑戰(zhàn)。擴(kuò)增子測(cè)序可以克服傳統(tǒng)分離培養(yǎng)的弱點(diǎn)，對(duì)樣品中的微生物進(jìn)行定性和定量，目前在微生物多樣性檢測(cè)中廣泛應(yīng)用。 16S+ITS測(cè)序的原理和用途：
16SrDNA測(cè)序：16SrDNA是編碼16SrRNA的基因，存在于所有細(xì)菌基因組。其既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異，又能利用測(cè)序技術(shù)較容易地得到其序列，目前被廣泛用于病原菌的檢測(cè)和鑒定。它的可變區(qū)經(jīng)常用于不同微生物群落的屬或種系統(tǒng)進(jìn)化分類(lèi)。
ITS測(cè)序：在真核生物中，18SrDNA和28SrDNA轉(zhuǎn)錄間隔序列稱為ITS區(qū)。由于其是非轉(zhuǎn)錄區(qū)，承受的選擇壓力較小，變異強(qiáng);屬于中度保守區(qū)域，利用它可研究種及種以下的分類(lèi)階元。
16S+ITS測(cè)序技術(shù)優(yōu)勢(shì)：
較低的成本：與宏基因組測(cè)序相比，對(duì)測(cè)序深度的要求更低，性價(jià)比較高；
鑒定效率高：與克隆或培養(yǎng)等傳統(tǒng)鑒定方法相比，微生物群16S/ITS測(cè)序是一種更快、更準(zhǔn)確的方法。
高靈敏度：可以鑒定出豐度極低的細(xì)菌。
雙區(qū)檢測(cè)：針對(duì)一個(gè)或多個(gè)可變區(qū)域的靈活性，能夠進(jìn)行更長(zhǎng)的序列讀取，并能夠?qū)溥M(jìn)行更準(zhǔn)確的分析。
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